​​​​​​​​​​​​​Nel 1989, il Comandante della Regione Militare Nord Est, interpellato l'Ordinario Militare per l'Italia, diede inizio, per mezzo del Genio Militare, ai lavori di ripristino della copertura pericolante del fabbricato ex Chiesa del Monastero da S. Prosdocimo, non più adibito a magazzino, anche in osservanza della prescrizione del 1988 della Soprintendenza dei Beni Ambientali ed Architettonici del Veneto di procedere al restauro conservativo della stessa per il suo inestimabile valore artistico.

Il 10 aprile 1990, Domenica delle Palme, alla presenza del Vescovo di Padova, Mons. Antonio Mattiazzo, di numerose Autorità Militari e Civili, di tutti i Cappellani Militari della zona, delle Associazioni dei Militari in congedo e della popolazione civile (il Duomo era gremito), l'Ordinario Militare solennemente consacrò la Chiesa.