Il 5° Reparto, tramite i suoi Uffici assolve diversi compiti nel settore delle infrastrutture. I principali sono:
La progettazione di strutture ed impianti, l'affidamento e la direzione lavori nella realizzazione di infrastrutture del Demanio Militare.
L'adattamento, le trasformazioni la manutenzione ordinaria e straordinaria delle infrastrutture di pertinenza.
Il 5° Reparto Infrastrutture, svolge la funzione di organo tecnico di consulenza delle Prefetture in materia di bonifica bellica. In tale ambito, cura l'emanazione delle modalità tecniche ed esecutive per l'effettuazione della bonifica bellica sistematica a cure di ditte private accreditate dal Ministero della Difesa.
Inoltre, il Reparto cura la gestione tecnico amministrativa degli alloggi demaniali nonché il trattamento delle pratiche immobiliari delle infrastrutture dell'Esercito Italiano relative ad acquisizioni, permute, imposizioni di servitù militari.